他們擁有夢想。　　總有一天，飛向廣闊天空的夢想。　　知曉被玻璃遮蓋的這片天空有多麼遙遠。　　遙遠的未來。　　人類在荒廢的大地上建設了移動要塞都市“種植園”，並謳歌着文明。　　在那當中建造的駕駛員居住設施“米斯特汀”，通稱“鳥籠”。　　孩子們就住在那裏。　　對外面的世界一無所知。　　對自由的天空一無所知。　　他們被告知的使命，只有戰鬥而已。　　敵人是一切都被謎團覆蓋的巨大生命體“叫龍”。　　爲了對抗尚未見過的敵人，孩子們乘上被稱爲“FRANXX”的機器人。　　他們堅信，乘坐其中，就是對自己存在的證明。　　有一位曾被稱作神童的少年。　　代號016。名字是廣。　　但他現在卻跌落谷底。　　是不被人需要的存在。　　如果沒有乘上FRANXX，就如同不存在一樣。　　在這樣的廣面前，某天，一位被稱作02的神祕少女出現了。　　她的額頭，長着兩根豔麗的角。　　“——找到了哦，我的DARLING”