全劇39個日日夜夜，京味兒、藥味兒、火藥味兒，驚心動魄；家族、懸疑、情愛，扣人心絃——　　1948年（民國37年）12月24日，北平。一派大戰前的倉皇景象：電臺裏不時傳出被圍的消息，報童在奔走呼號，街頭到處是“買兩塊，賣兩塊！”的銀元倒賣聲，軍警驅趕着遊行隊伍，東單機場南逃的飛機像蒼蠅一樣飛上飛下……　　同仁堂在北平立世二百七十餘年，如今卻面臨着歇業的危險。大爺樂柏齡去祁州開市被劫，藥料難以爲濟；三爺樂柏松用轎車換了頭驢馱着三奶奶從被圍的天津死裏逃生……讓同仁堂離開古都南遷？掌櫃的二爺樂柏年必須做出選擇。　　一車藏滿金條的白菜途中失蹤，使共產黨的地下金庫洪昇錢莊被警方楊冠雄查封，一褡包金條轉移途中遺失在一輛水車裏。花旗銀行總代表張友鵬（地下黨）索尋金條，其間一波三折，撲朔迷離，在樂家大小姐樂蓮珊的幫助下，終將金條找回。從此，同仁堂的命運便與共產黨的金庫緊緊連在一起……國府特派員黃家才的使命是帶同仁堂離開北平，他自然不能眼看共產黨金庫源源不斷的資助同仁堂。於是，在黃家才與樂柏年、張友鵬之間，一番生與死的較量展開了，樂家人面臨着一個接一個的殘酷考驗——　　悍匪小青龍受黃家才指使劫持二小姐樂小珊，酷愛養鴿子的四爺樂柏壽拎着一對兒名鴿“白鸕鷀”去贖人，卻被吊到了房樑上，大鼓名角董天嬌一曲《風雨歸舟》唱出了對四爺的愛；天橋名罵大糞坑到樂家門前罵街；假藥一夜間充斥街頭，樂柏年一把燒假的大火在北平百姓心中燃了幾十年；爲保護張友鵬的“貨”，樂柏年和他攜手進了黃家才的保密局大獄；爲恪守“炮製雖繁必不敢省人工，品味雖貴必不敢減物力”的祖訓，樂二爺廢了藥、劈了籮；小青龍在照相館殺害了正和四爺照結婚照的董天嬌，樂家的未來女婿孫浩飽受保密局迫害，爲保全同仁堂，他高聲朗誦高爾基的《海燕》，縱身跳下了高塔，樂柏壽和樂小珊成了一對只會放信鴿的癡人兒；大年三十，同仁堂臨別前夜卻“金豬拱門”，新年吉兆。樂柏年、張友鵬、黃家才、楊冠雄四個不同的人坐在了同一張麻將桌上，成敗興亡、是非功過俱在這一方築起的“長城”中評說；初一一早，黃家纔將押二爺南遷，樂柏年和同仁堂就這麼走了？……　　樂柏年做出了選擇。“自漢以降，時越千年……天地有正氣，潤吾百草鮮。唯吾知滋味，善把苦做甘。頂禮頌高潔，玉碎不瓦全！”祖先堂內，他雄渾有力的《寶碾賦》喚醒了所有樂家人，也喚醒了所有北平人——所有面臨選擇的中國人。39天裏，有人死了，有人生了，有人走了，有人留下。然而，不變的卻是紫禁城，鐘鼓樓，天壇，這千年古都。留下的人留下了，走的人走了，不變的是共同的希望，看似分了的一切，其實是合了……　　公元1949年，1月31日。北平和平解放，同仁堂祁州開市。